一、土建方面

凡是牵涉到开门、开洞的情况，均应与原土建设计部门取得联系，不得擅自做主。不能对原有建筑的基础和结构进行根本性改变。

牵涉到防火分区改变的或对防火分区面积进行改变的，应重新进行消防报批。没有自动喷淋系统的应加装自动喷淋系统，消防水池要根据实际设计量进行配置。
二、设备安装
除开门和开洞外，增加货架设备有时也会影响到消防报批问题（如高层货架、阁楼货架、立体库等）。
大型设备安装还涉及到吊装问题，应妥善选择吊装位置，此外，还要考虑道路和安装孔洞等问题的影响。
自动化设备需要更大的用电负载，需按实际需要进行扩容。
有些设备（如机械手），需要对建筑局部进行加固，应在计算的基础上，选择合适的方法进行。

三、系统接口
站台与停车场：这一部分是非常难以改造的部分。因为有很多的老库房根本没有设计站台，而且停车位空间狭小，难以改造。但作为现代物流系统来说，这一点其实非常重要。其实也是整个系统能否达到设计目标的重要组成部分。
门：重新开门是必要的。除此之外，还包括位置的调整以及门的尺寸调整。
载荷：基础承载能力应符合设计要求。有时楼面承载能力达不到要求，如果不能加固，则智能修改设计方案。
网络：现代仓库要求有覆盖全场的网络，这是许多老仓库不具备的条件。因此，网络改造非常重要。
交叉施工：有时存在交叉施工问题。尤其是部分改造的项目，还要面临施工与业务的冲突。这是改造的困难点之一。
系统切换：新业务的切换是比较容易实施的情况，但如果情况不是这样，搬迁与系统切换就显得非常关键。要对此保持足够的重视。
其它方面
房屋的使用寿命与设备的选择：设备的使用寿命。如一些老旧仓库的使用寿命已经接近设计值，这时就不宜选择高度自动化的设备，而应该寻求与之匹配的设备。如可拆迁、可移动的设备等。
重建与改造的选择：要兼顾短期效益与长期效益。有时虽然新建库需要很多手续，但也不失为一种选择。主要决策依据是效率和效益。为此，应进行认真的分析。