1、收集相关资料，明确设计需求
⑴自动化立体库与上下游工序的协作过程:如验收区、平置区、拆零库、不合格品区、发货区的工序业务衔接；
⑵上游最大出库量、下游最大出库量、立体库最大库容，出入库和补货、移位频度；
⑶货品品类、包装形式、外观尺寸、堆垛层高上限、重量和属性要求（通常要求药品与非药品、内用药与外用药之间间隔一个托盘位）；
⑷温湿度和环境要求，通常医药流通领域自动化立体库为阴凉库，湿度35%-75%，温度0-20摄氏度。如果是冷库（2-8摄氏度），则需对堆垛机、穿梭车、输送机、货架等设备采用耐低温、耐低湿处理，保障其能在低温低湿环境中稳定高效运行；
⑸公司ERP、WMS、WCS对自动化立体库管理系统的要求；
⑹仓库管理人员的其他要求。
2、确定自动化立体仓库的形式和相关技术参数
结合第1项所了解的资料计算出储存区所需要货架的排数、列数，巷道数目其它相关技术参数。
3、设计自动化立体库的整体布局并绘制物流图
一般来说，一家医药物流仓库至少应包括收货区、验收区、整板存储区（含拣货、复核区）、整件存储区（含拣货、复核区）、拆零区（含拣货区和复核打包区、包材区）、特殊药品库（中药材区、中药饮片库、医疗器械库等）、冷库、发货区（含集货区、理货区和装车区）和收货、发货、调度办公室等区域（自动化程度不高的仓库要规划叉车、托盘、周转箱、经营车和劳保用品摆放区及茶水间等区域），通常整板存储区采用自动化立体库。
如果整体规划，就相对比较容易，根据第一项调查的信息，合理规划库容，设计线路即可（注意货品不走回头路，整箱和逆向货品不要发生交叉和湍流）。
如果是单独设计自动化立体库，就要特别注意与其他各区域的协调性，以确保整体效率最高。
4、选择设备类型和参数
⑴货架
①确定货架形式：常用的货架有横梁式、牛腿式、流动式等，设计时根据货物单元的外形尺寸、重量及其它相关因素选取。
②货格的尺寸：货格的尺寸取决于货物单元与货架立柱、横梁（牛腿）之间的间隙大小，同对，在一定程度上也受到货架结构型式及其它因素的影响。
货架的设计是立体仓库设计的一项重要内容，直接影响到立体仓库面积和空间的利用率。
⑵堆垛机
①确定堆垛机形式：常见的有单轨巷道式堆垛机、双轨巷道式堆垛机、转巷道式堆株机、单立柱型堆垛机、双立柱型堆垛机等。
②确定堆垛机速度：根据仓库的流量要求，计算出堆垛机的水平速度、提升速度及货叉速度，需要说明的是，单个设备的速度快不一定会带来整体速度和效率的提升，关键是整体的协调和配合。
③其它参数及配置：据仓库现场情况及公司要求选定堆垛机的定位方式、通讯方式等。堆垛机的配置可高可低，视具体情况而定。
⑶输送系统
根据物流图，合理选择输送机的类型，包括：辊道输送机、链条输送机、皮带输送机、升降移载机、提升机等。同时，还要根据仓库的瞬时流量合理确定输送系统的速度。
⑷其它辅助设备
根据仓库工艺流程及用户的一些特殊要求，可适当增加一些辅助设备，包括：手持终端、叉车、平衡吊等，有条件的企业也可以选用码垛机器人、AGV等。
5、设计WCS和WMS各功能模块
根据仓库的工艺流程及公司的要求，合理设计控制系统及仓库管理系统（WMS）。控制系统及仓库管理系统一般采用模块化设计，便于升级和维护。
6、方案测试
在电脑上对整套系统贮运工作进行仿真模拟，查找问题和不足，并作出相应的调整，直至整个立体库运行平稳。
7、方案细化和落地